《美国队长二》时神盾局是怎么回事？
简单来说，就是被“九头蛇”组织给渗透了！在漫威影版设定中，九头蛇组织和神盾局两者之间算是死对头，这其中影版宇宙中，九头蛇由“红骷髅”创办，一直以颠覆整个世界，并掌控世界为目标，而神盾局的创立则是恰恰相反。在电影系列中，在二战结束之后（时间线美队1之后），九头蛇因为策划了众多暗杀、恐怖行动，一度成为了神盾局打击的目标。
参考：《钢铁侠3》中，受到九头蛇控制的冬兵，击杀钢铁侠父母的剧情。但是不同于二战时期红骷髅掌控九头蛇时，整个九头蛇组织在地面的行动招摇，在《美队1》之后，当红骷髅被无限宝石传送到了沃米尔星当灵魂宝石指引者后，整个九头蛇的行动都转移到地下。而《美队2》中，神盾局被九头蛇入侵，正是建立在这一背景基础上！《美队2》中，整个故事源自于一次美队和寡姐接受到的一艘被海盗劫持的名为莫里亚之星的神盾局营救人质计划，解救过程很顺利，但是在结尾中，美队发现了，其实寡姐暗中接受了来自尼克弗瑞的第二任务——备份神盾局船只“莫里亚之星”号的全部资料。
至此，整个《美队2》九头蛇入侵神盾局的主线剧情开始，需要了解的只有一个关键词“洞察计划”！看过电影的粉丝都清楚，整个“洞察计划”说白了就是：“清除一切可能会对九头蛇造成影响和威胁的目标，不论是现在还是未来”。而通过的手段就是，一开始尼克·弗瑞领导建造的“空天母舰”，但是因为在解密莫里亚之星号上黑寡妇送来的加密文件时，尼克·弗瑞感觉到了来自神盾局内部的不对劲——神盾局可能被九头蛇入侵。
因为在这份加密文件中，尼克弗瑞发现自己身为神盾局局长，十级特工权限居然没有权限，而加密这份文件权限的人，居然是尼克·弗瑞自己？！这才使得尼克·弗瑞察觉到了九头蛇可能会对空天母舰有想法，于是在向神盾局前局长亚历山大·皮尔斯提出推迟空天母舰计划，但没过多久就遭到了九头蛇的追杀。显然，前局长亚历山大·皮尔斯本身也是一名“九头蛇”。
随后的剧情也正是按照这个路线继续发展下去——九头蛇利用前局长亚历山大·皮尔斯的权限，大肆发布对美队以及尼克·弗瑞等人的逮捕命令，而这其中尼克·弗瑞一度不得不借助假死来使得自己脱险。而美队和寡姐则是踏上了寻求真相之旅。也正是在这之后，神盾局的空天母舰一度成为了九头蛇来清除对自己有威胁的目标的武器，按照九头蛇卧底的话来说，一次清除目标数量在几百万左右，涉及到了班纳、奇异博士等人。
