封王戍边的原因，一个是因为京城离边塞太远，封王戍边刚好可以起到让藩王守边的作用；二是这一行为体现了朱元璋的朴素和小家的思想，他认为老子打了天下就应该让子孙们帮着一起守；三是为了避免争权夺利，嫡长子一旦被立为太子，其他皇子就必须离京，而封藩则可以在异地解决他们的身份问题。所以，洪武皇帝的封藩制既有不利的一面，也有有利的一面。
齐泰在洪武皇帝还没有死的时候，朱允炆已经开始思考如何对他的这些叔叔下手了。建文时代，围绕在建文帝身边的就是方孝孺、齐泰、黄子澄这三名儒臣。跟方孝孺鼓捣建文帝复古不同的是，齐泰、黄子澄鼓捣的是削藩，齐泰建议先削燕王，而黄子澄建议先削势力弱小的藩王。建文帝最终采纳了黄子澄的意见。实际上，先削谁、后削谁都已经不重要，关键的是削藩此举既违背洪武宪法，又不得人心。
黄子澄建文皇帝的第一刀挥向了周王朱橚。周王是朱棣的同母弟弟，处理了周王就等于剪除了燕王的一只臂膀。建文帝的动作相当快，朱元璋死了一个月，他就动手了。周王痴迷于医学，他自己种植植物园，自己品尝药材。建文帝拿下周王后将他发配云南。云南这个边远的地方给周王的医学研究以很大的便利，那里有丰富的物种、有奇花异草、有烟瘴、有长期患病无法得到医治的民众。
周王到了云南便联合当地的医官开始研究医药、著书。虽然朱棣夺得皇位后给了周王自由，但周王的一生都在钻研医学的抑郁中度过。张三丰周王被削后，湘王、齐王、代王、岷王又进入了建文皇帝的视野。厄运很快降临到湘王朱柏头上。朱柏跟周王朱橚一样也是个文化人，解缙对他的评价相当高，说他“幼而美异，长而通明，温恭粹德”。
朱柏除了文采好，武功也不错，他还是个虔诚的道教徒。跟朱元璋和朱棣一样，他也寻访过张三丰。周王朱橚建文元年（1399年）四月，建文帝以谋反罪和私印钞票罪着有司兵马逮捕朱柏进京询问。朱柏为了免受刀笔小吏之辱，全家自焚而死，时年28岁。即使是建文帝这样的仁君，在面对政治斗争的时候依然是毫不手软。而以黄子澄、齐泰为首的削藩者，打着儒教、礼治的旗号，在面对自己的利益受威胁时仍旧是行霸道、走诈术。
我们可以很明显地在这里看到双重标准。建文帝可不是一个简单的孩子，如果你认为他老实，那你就错了。在洪武三十一年（1398年），建文帝刚处理完周王，对其他四个藩王的处理还没有开始的时候，对燕王的处理就已经开始了。从洪武三十一年（1398年）十一月起，大批的军队和锦衣卫被派往北平监视朱棣。燕王朱棣在建文帝削藩如火如荼的时候，朝中的不同声音一直没有断过。
建文帝也曾犹豫过，但都被齐泰、黄子澄硬顶了下来。从建文元年（1399年）开始，北平与南京之间消息不断，气氛一天比一天紧张。到了六月，燕王的左护卫百户倪琼进京被锦衣卫捕获，供出了燕王准备谋反的情况。建文帝得知后只得提前动手。建文帝首先动手了，派去捉拿燕王的军队反被燕王府的卫队打败。接着，燕王的卫队乘势夺取了北平九门，控制了北平防务。
燕王若想南下，还必须控制整个北平的外围，这样才能有一个稳固的后方。于是燕王便率领王府的卫队和从外地奔来的燕王卫队迅速扫荡了北平的外围，控制了整个北平周围要地的防务。内战终于爆发了。燕王已经营北平多年，手下燕军已经是帝国战斗力最强的军队。在燕王的攻击下，北平周围中央军的迅速溃败也就不难理解。而且，因为燕王的人脉熟络，还有不少中央军投降燕军，进一步增大了燕军的实力。
《明皇祖训》燕王既然要谋反了，总要找一个谋反的理由吧。其实理由很好找，翻翻史书就找到了。对于燕王其实不需要翻史书，翻翻《明皇祖训》就知道了。朱元璋为了防止后世子孙变质，专门刊印了《明皇祖训》。《明皇祖训》中记载了这样一条，如果朝中出现奸佞，各地藩王有权力带兵进京勤王。朱元璋封王除了戍边外，也是为了防止江山变色，可这条记录却给朱棣的谋反提供了借口，而且还是合法的借口。
的确，朱元璋在世的话也会支持朱棣这样做，黄子澄、齐泰的做法已经超出了一个人臣的本分。建文帝刚即位，大明皇族便已是刀光剑影，这虽然出自建文帝的圣裁，但齐泰、黄子澄的推波助澜也不无作用。建文元年（1399年）七月，燕王朱棣打起了“靖难”的大旗，并发布对建文帝本人和黄子澄、齐泰一系列的指责。这些指责在当时看起来似乎比黄齐的削藩和方孝孺的周礼更能争取人心。
